12月5日，新公民计划荣获2008年度“中华慈善奖”之“最具影响力慈善项目”奖。
被民政部评为4A基金会，这是民政部主管的非公募基金会的最高评级。
被评为“全国先进社会组织”,南都基金会成为民政部主管的非公募基金会唯一获奖机构。
2月，被民政部4A级社会组织。
2月，被民政部评为全国先进组织。
6月，荣获中国社会工作协会“民族社会工作组织奖”。
荣获“责任中国2011公益盛典—公益组织奖”。
1月5日，南都基金会被上海绿丝带志愿者服务中心评为2010年度项目合作伙伴。
12月11日，荣获“责任中国”2011年公益盛典之公益组织奖。主办方对南都公益基金会做出较高评语：为天下培育公民，为社会保育民间组织，为公益界贡献标准，为中国准备正面能量。南都公益基金会取财有道，散财亦有道。正所谓：亦仁亦德亦智信，千金尽散归苍生。
被评为“最受草根组织欣赏的基金会”。
位居中国公益慈善组织透明度首位。
11月28日，荣获零点民生金铃奖组委会—2012年民声金铃奖之“金铃.励”奖。
荣获中国基金会评价榜“金桔奖”。
荣获南都周刊中国温度榜“年度团队奖”。
8月18日，荣获“抗震救灾援建爱心集体奖”。
9月，被中民慈善捐助信息中心评为“2013年度1000家中国公益慈善组织信息披露情况抽样调查卓越组织”。
12月23日，收到共青团雅安市委员会、雅安抗震救灾社会组织和志愿者服务中心、雅安市群团组织社会服务中心“关心支持雅安灾后重建单位感谢信”。
6月30日，被中国公益研究院授予“善治典范”称号。
10月10日，被民政部评为4A级社会组织。
12月31日，获得慈善组织认定。
获得《2018年中国最透明慈善公益基金会》榜单第6名，非公募类别排名第1。
第三次蝉联金桔奖，获誉“最能引领和推动领域发展的基金会”。
2012年-2018年，持续获得中国基金会透明指数（FTI）100分满分。
荣获第十六届（2019）中国慈善榜·榜样基金会。
获得界面新闻《2019年中国最透明慈善公益基金会》榜单第1名。
连续8年获得中基透明指数FTI满分，获得自律透明榜样奖。
好公益平台纪录片《人，如何面对孤独》获得2019中国公益映像节基金会类最佳作品奖、最佳感人短片奖
《中国社会企业与社会投资行业扫描调研报告》入选十七届中国慈善榜“优秀公益研究报告”
南都基金会“行业建设”项目入选《慈善与可持续发展——中国行动2020》报告SDG17 伙伴关系
南都基金会连续四届蝉联“金桔奖”
界面新闻2020年度透明慈善公益基金会榜单第二名
好公益平台入选WINGS（全球资助者支持计划）#LiftUpPhilanthropy倡议典型案例
2021年中基透明指数FTI获得100分，评级A+
2022年中基透明指数FTI获得100分
好公益平台荣获“坚韧的力量”2022年度慈善盛典——年度优秀案例
南都公益基金会荣获2023中国慈善榜年度榜样基金会
2023年中基透明指数FTI获得100分
